除落實國家研究船隊防疫規範及中央防疫措施外，鑑於病毒潛伏期可能大於7日，新海研2號將再強化防疫措施：

（一）研究人員部分：出航前14日確診但已痊癒並且解除隔離者、曾密切接觸染疫者但已完成自我隔離者，即使快篩為陰性，仍予柔性勸阻上船。

（二）船員部分：依中央與航港局防疫指示處理，但視實際情況做彈性調整。例如：在出航人數足夠且不影響勤務之情況下，經確診解除隔離或密切接觸解隔離者，仍會要求該航次休息。